藥師法既不離世間法，故必會通世間自然科學、社會科學以為研究，能破除宗教之偶像、教條和迷信等等。藥師法既不離出世間法，故亦必會通佛法大小乘、顯密教以為研究，才能破除世間之小我、妄執和邪見等等。至於藥師法的本質就是藥師定。《藥師經》是藥師法的說明，藥師法是藥師定的作用，而藥師定的本質就是色、息、心法。人為色息心之一具，修藥師定者，教人明乎自己色息心之所由具，以及如何用此色息心之所具而做頂天立地之人也。亦即教人如何在生活中了生死，而又在了生死中生活也。所以藥師經法是教人生活做人之大法，是教人即生即身認識人身人生而改造人身人生之大法也。釋迦為人間之本師，藥師為人道之本尊，大日為天道之本尊。修密教者，修人道也。而修藥師法者，是正修人道，以人合人，以人合天，天人合一也。故藥師經法，是人間佛教正信正念、正知正見、正定正命之正法也。
